Cum s-a autodistrus COVID în Japonia?

Cum s-a autodistrus COVID în Japonia?
Cum s-a autodistrus COVID în Japonia?
Anonim

De ce al cincilea și cel mai mare val al pandemiei de coronavirus din Japonia, condus de varianta super-contagioasă „Delta”, s-a încheiat brusc după o creștere aparent necruțătoare a noilor infecții? Și ce a făcut Japonia diferită de alte țări dezvoltate care acum înregistrează o nouă creștere a cazurilor?

Potrivit unui grup de oameni de știință japonezi, răspunsul surprinzător poate fi că varianta Delta s-a îngrijit de la sine într-un act de „autodispariție”.

La trei luni după ce varianta Delta a provocat cazuri record la nivel național de aproape 26.000 de cazuri zilnice, noile infecții cu COVID-19 din Japonia au scăzut brusc, scăzând sub 200 în ultimele săptămâni. Pe 7 noiembrie, de exemplu, nu au fost raportate decese - prima dată în aproximativ 15 luni.

Mulți oameni de știință indică diverse posibilități, care includ una dintre cele mai mari rate de vaccinare din Japonia în rândul țărilor dezvoltate, la 75,7% dintre rezidenți. Alți factori potențiali sunt distanțarea socială și măsurile de purtare a măștilor, care sunt acum profund încorporate în societatea japoneză.

Dar motivul principal poate fi legat de modificările genetice pe care le suferă coronavirusul în timpul reproducerii sale, cu o rată de aproximativ două mutații pe lună. Potrivit unei teorii potențial revoluționare, propusă de Ituro Inoue, profesor la Institutul Național de Genetică, varianta Delta din Japonia a acumulat prea multe mutații ale proteinei nestructurale, care corectează erorile virusului, numite nsp14. Drept urmare, virusul se străduiește să corecteze erorile la timp, ceea ce a dus în cele din urmă la „autodistrugerea”.

Studiile arată că majoritatea oamenilor din Asia au o enzimă protectoare numită APOBEC3A care atacă virusurile ARN, inclusiv virusul SARS-CoV-2 care provoacă COVID-19, în comparație cu oamenii din Europa și Africa. Prin urmare, oamenii de știință de la Institutul Național de Genetică și Universitatea Niigata și-au propus să descopere modul în care proteina APOBEC3A afectează proteina nsp14 și dacă poate inhiba activitatea coronavirusului

Echipa a analizat datele privind diversitatea genetică a variantelor „Alfa” și „Delta” la pacienții infectați din Japonia, din iunie până în octombrie.

Au vizualizat apoi relațiile dintre secvențele ADN ale virusului SARS-CoV-2 pentru a arăta diversitatea genetică într-o diagramă numită rețea de haplotip. În general, cu cât rețeaua este mai mare, cu atât reprezintă mai multe cazuri pozitive.

Rețeaua variantei „Alpha”, care a fost principalul motor al celui de-al patrulea val în Japonia din martie până în iunie, are cinci grupuri mari cu multe mutații ramificate, confirmând un nivel ridicat de diversitate genetică. Oamenii de știință cred că varianta „Delta”, despre care Centrele pentru Controlul și Prevenirea Bolilor din SUA spun că este de două ori mai contagioasă decât variantele anterioare și poate provoca boli mai severe la persoanele nevaccinate, va avea mult mai multă diversitate genetică vie.

Este surprinzător, dar oamenii de știință japonezi au descoperit fapte care demonstrează contrariul. Rețeaua de haplotipuri are doar două grupuri majore și mutațiile par să se oprească brusc în mijlocul procesului lor de dezvoltare evolutivă. Când oamenii de știință au continuat să studieze enzima de corectare a erorilor a virusului nsp14, au descoperit că marea majoritate a probelor de nsp14 din Japonia părea să fi suferit multe modificări genetice la locurile mutațiilor, numite A394V.

„Am fost literalmente șocați când am văzut rezultatele”, a declarat prof. Inoue pentru The Japan Times. - Varianta „Delta” din Japonia a fost foarte infectată și nu permitea alte variante. Dar, pe măsură ce mutațiile s-au acumulat, credem că în cele din urmă a devenit un virus defect și nu a reușit să facă copii ale lui însuși. Având în vedere că cazurile nu cresc, credem că, la un moment dat, în timpul unor astfel de mutații, s-a îndreptat direct către dispariția sa naturală.”

Teoria profesorului Inoue, deși inovatoare, susține dispariția misterioasă a variantei Delta răspândite în Japonia. În timp ce mare parte din restul lumii, cu rate la fel de ridicate de vaccinare, inclusiv Coreea de Sud și unele țări occidentale, suferă de valuri record de noi infecții, Japonia pare a fi un caz special, deoarece cazurile de COVID-19 au rămas reduse în ciuda faptului că trenurile și restaurantele se umplu după încheierea ultimei stări de urgență.

„Dacă virusul ar fi în viață, cu siguranță cazurile ar crește, deoarece purtarea măștilor și vaccinarea nu previn focarele bruște de infecții în unele cazuri”, a menționat prof. Inoue.

Scăderea cu adevărat neașteptată a cazurilor noi după valul estival este un subiect fierbinte de discuție printre mulți experți, inclusiv cei care nu efectuează cercetări asupra coronavirusului, potrivit Takeshi Urano, profesor la Școala de Medicină a Universității Shimane. care nu a participat la cercetarea condusă de prof. Inoue.

Image
Image

„Nsp14 funcționează cu alte proteine virale și are o funcție critică de a proteja ARN-ul viral de degradare”, spune el când a fost întrebat despre Prof. Inoue. - Studiile arată că un virus cu nsp14 infirmă are o capacitate semnificativ redusă de a se replica, așa că acesta poate fi unul dintre factorii din spatele declinului rapid al noilor cazuri.”

Veștile bune sunt că Nsp14 a fost acum extras cu succes din virus, iar un agent chimic care să limiteze această proteină poate deveni un medicament promițător, cu dezvoltare în curs.

Japonia pare a fi o anomalie, deoarece varianta Delta oprește efectiv răspândirea Alpha și a altor variante covid până la sfârșitul lunii august. Pe de altă parte, restul țărilor – inclusiv India și Indonezia, care au fost deosebit de puternic afectate de varianta Delta – au raportat o combinație de tulpini Alpha și Delta printre cazuri.

„Dispariția naturală similară a coronavirusului ar putea fi observată în străinătate”, a spus prof. Inoue, adăugând că ar fi dificil de detectat, deoarece nicio altă țară nu pare să fi acumulat atât de multe mutații în nsp14 a virusului, ca în Japonia, deși mutații similare la site-ul A394V au fost găsite în cel puțin 24 de țări.

Teoria profesorului Inoue poate ajuta, de asemenea, să explice de ce focarul de sindrom respirator acut sever (SARS) s-a încheiat brusc în 2003. Un experiment in vitro în care oamenii de știință au indus mutații în virusul nsp14, provocând SARS, ducând la concluzia că în cele din urmă nu se poate reproduce, deoarece mutațiile se acumulează în el.

„Nu există date despre genom, deci este doar o ipoteză, dar din moment ce a dispărut, nu va mai vedea niciodată lumina zilei”, spune prof. Inoue.

Deci, care sunt șansele de a vedea o extincție naturală similară în străinătate a virusului SARS-CoV-2 care provoacă COVID-19?

„Șansele nu sunt zero, dar acest lucru pare prea optimist pentru moment, deoarece nu putem obține astfel de dovezi, deși am analizat diverse date și din celel alte țări. După ce a atins vârful la mijlocul lunii august, numărul de cazuri zilnice de COVID-19 din Japonia a continuat să scadă, până la 5.000 până la jumătatea lunii septembrie și sub 200 până la sfârșitul lunii octombrie.

De ceva timp, țara s-a bucurat de una dintre cele mai scăzute rate de infecție dintre toate țările avansate, dar nu este imună la următorul val al pandemiei, spune prof. Inoue. - Evident că există o ameninţare. Am fost bine pentru că Delta din Japonia a ținut celel alte variante ale coronavirusului în afara țării. Dar acum, că nu există nimic care să-i țină la distanță, s-a făcut loc pentru altele noi, iar vaccinurile singure nu vor rezolva problema. În acest sens, cred că măsurile de carantină pentru controlul imigrației sunt foarte importante, pentru că nu știm niciodată ce ne poate veni din alte țări.”

Unii oameni de știință au speculat că auto-extincția variantei Delta în Japonia este cauzată de ceva special în genele japonezilor, dar prof. Inoue nu este de acord.

„Nu cred - prof. Inoue este emfatic. - Oamenii din Asia de Est, precum coreenii, sunt etnic la fel ca japonezii. Dar nu știu de ce această observație a fost făcută doar în Japonia.”

Prof. Inoue mai spune că echipa de cercetători de la Institutul Național de Genetică și Universitatea Niigata intenționează să facă un studiu amănunțit al descoperirilor lor până la sfârșitul lunii noiembrie.

Recomandat: